スラッシュドット・ジャパン

　Mozilla は終了時に現在の設定を prefs.js に書き出すので、Mozilla を動かしたまま prefs.js を書き換えて一度 Mozilla を終了させるとせっかく書き換えた prefs.js が上書きされてしまいますね。
　namatias さんのコメント [slashdot.jp]のように Mozilla を終了させてから prefs.js を書き換えるのが正解です。
　Windows 版で Quick Launch を有効にしている場合はシステムトレイに常駐している Mozilla も終了させないとダメなのでこちらも注意が必要です。

> 250ms にして、一度モジラを終了させるだけ。
一度モジラを終了して、250msにするだけ。

元ネタには確かに

> Now let's get to applying the tweak, first you need to add the
> line to your prefs.js, and then remove write perms on the
> file or else Mozilla will overwrite it on startup and remove
> your tweak, here's how to do it:

と書かれてますが、私の所では -w しなくてもちゃんと設定が保存されてますね。
prefs.js は 644 なんですが。
他の設定を変えてみても大丈夫みたい。

mozilla 1.1 です。
うちの CPU は Pen III/450 なんですが、残念ながらあまり効果は感じられないです(T_T)

　Windows 版の Phoenix 0.5 [mozilla.org] ですが、インストール直後のなにもいじっていない状態で about:config を見ると nglayout.initialpaint.delay の Status は default でなおかつ Value が 250 となっています。
　どうやら Phoenix では (少なくとも 0.5 では) 最初から 250ms に設定されているようです。