Blue Gene/LでGNU Octaveを動かした 11
ストーリー by nabeshin
みんなで使うには慣れたのがいいよね 部門より
みんなで使うには慣れたのがいいよね 部門より
Anonymous Coward曰く、
スウェーデンで教育・研究機関で向けに計算機リソースを提供しているPDCのサイトにて、対話型数値計算ソフトウェア「GNU Octave」をBlue Gene/Lにインストールしたレポートが掲載されています(MPITB and Octave on Blue Gene/L)。これなら、TERA FLOPSマシンを動かすのに、面倒なプログラミングをしなくて良さそうです。
発端はこちら (スコア:3, 興味深い)
Sun Oct 12 12:26:25 CDT 2008
"Hi
I am trying to compile MPITB\octave on IBM Blue\Gene L."
これ読んだ時は,びっくりしましたよ.
そういや,Parallel Octaveのページがあるなと思って
Octave Parallel Computing, powered by LAM/MPI and Open-MPI [atc.ugr.es]
をみたら,"Kungliga Tekniska Högskolan Sweden KTH ( > ParallelDatorCentrum > Systems Support > Computers > hebb > Octave on BlueGene > )"のリンクがあるじゃありませんか.
Octave on Blue Gene [pdc.kth.se]をみると,インストールできてるんで,またびっくり.
Re:発端はこちら (スコア:1, 興味深い)
Re:発端はこちら (スコア:1)
Matlab: Parallel Computing Toolbox - Parallel Programming in MATLAB Demo [mathworks.com] gridMathematica:Mathematicaのパワーと最新の計算クラスタやグリッドを統合 [wolfram.com]
どっちもライセンス料は高そうですが.
linux+mpi+octaveが安そうです:PelicanHPC: A GNU/Linux distribution to create a HPC cluster for MPI based parallel computing [pareto.uab.es]
実はまだ終わっていないようです (スコア:2, 参考になる)
Hi,
I have installed Octave 2.9.12 , MPITB and OpenMPI 1.2.3.
I am trying to compile MPITB for Octave 2.9.12.
But I got errors :
........
続きはこちらで....
THE HELP OCATVE - October 2008 Archives by thread [wisc.edu]
Re: (スコア:0)
気づいたらフルカスタムOctaveが出来上がった….
一方xxx(他のスパコン)は…どうしたんだろう?
Re:実はまだ終わっていないようです (スコア:1, 参考になる)
Top500の10位以内に入ってるような100TFLOPS越えのシステムであっても、
SuSEやRedHat等のメジャーなディストリがそのまま動いてるので。
むしろ、ベクトル機や共有メモリマシン、或いはBGのような専用機用に書いたコードを
HPCクラスタに持ってくほうがよっぽど大変な気が・・・
Re:実はまだ終わっていないようです (スコア:3, 参考になる)
わっちの使った環境は、標準で提供されているMPIライブラリが
専用コンパイラ専用で、けっこう辛かった。gccではMPIが使え
ないのですよ。
わっちの作ったコードはgccでしかコンパイル出来ないライブラリ
に依存していて死んだ。
Re: (スコア:0)
Re:実はまだ終わっていないようです (スコア:1)
というか, こういった用途では「動いた」と「速く動いた」の間には深い溝が存在しているわけで. 「動いた」のレベルならただの遊びに過ぎません.
Re:実はまだ終わっていないようです (スコア:2, 参考になる)
BLASといわれる行列計算用のライブラリーの性能を計るためにOctaveでは行列×行列の掛け算がよく用いられます。
(BLASと同じインターフェースの高速計算ライブラリがATLASです。MacだとvecLibフレームワーク。)
パソコンでは1000×1000の行列が多いですが、BLUE GENE/Lならもっと大きい行列が良いですね。
Re:実はまだ終わっていないようです (スコア:1)