y_tambeの日記： 豚インフルエンザは「弱毒性」 3
日記 by
y_tambe
コメントにつけた内容についての補足というか、検証した手順ですが。
PubMedで公開されてる各株のHAの配列について、K or Rが連続する部分があるかどうか、チェックしただけだったりします。例えば、A/California/04/2009(H1N1)のHAだと、塩基配列上の52-1032がHA1, それ以降がHA2なので、アミノ酸配列の344番目周辺を見て、KRが連続する部分（4-5残基の連続とか、2-3残基の連続が集中するとか）がないかを視認して確認可能です（HA1,HA2の位置情報がない株についても、まぁその近辺を見る）。まぁあくまで、「自分でも一応 verifyする」程度の簡便な方法なんで、あんまり過信してはいけないのは言うまでもありませんが……もちろん、他のHAの配列ときちんと比較するのが正しいやり方ですが、その辺りも自分でやって判断するより、別のきちんとした研究者が発表した内容をチェックする方がいいですから。
PubMedで公開されてる各株のHAの配列について、K or Rが連続する部分があるかどうか、チェックしただけだったりします。例えば、A/California/04/2009(H1N1)のHAだと、塩基配列上の52-1032がHA1, それ以降がHA2なので、アミノ酸配列の344番目周辺を見て、KRが連続する部分（4-5残基の連続とか、2-3残基の連続が集中するとか）がないかを視認して確認可能です（HA1,HA2の位置情報がない株についても、まぁその近辺を見る）。まぁあくまで、「自分でも一応 verifyする」程度の簡便な方法なんで、あんまり過信してはいけないのは言うまでもありませんが……もちろん、他のHAの配列ときちんと比較するのが正しいやり方ですが、その辺りも自分でやって判断するより、別のきちんとした研究者が発表した内容をチェックする方がいいですから。
もしご存知でしたら教えてください (スコア:0)
メキシコ帰りの人以外に感染者って出てるんでしょうか。
本当に人人感染しているのか疑問なんですが。
Re:もしご存知でしたら教えてください (スコア:1)
アメリカで最初にCDCから報告された患者（patient A and B）については、どちらもカリフォルニア南部（サンディエゴ）在住の子供でメキシコへの渡航歴はないようです（あったら「必ず」記載されてるはずですので）。また、彼らの家族（母親や兄弟）も、彼らの発症の数日後に発症しています。ここらへんのことから考えると、ヒト-ヒト感染があったと考える方が自然なので、CDCが比較的初期にその疑いがあると発表したことも妥当だと思います。正直言うと、個々のcase reportはチェックしきれていないのと、そもそも公開されてないものもないので、その他の事例について私は精査してませんが、その後CDCやWHOがヒト-ヒト感染についての考え方を方針転換してないことから考えても、ヒト-ヒト感染は起こっていると考えるのがやはり妥当かと。
Re:もしご存知でしたら教えてください (スコア:1)
>そもそも公開されてないものもないので
「そもそも公開されてるものも少ないので」の誤りです。すんません。